Cytoscape是一款圖形化顯示網(wǎng)絡(luò)并進(jìn)行分析和編輯的軟件,支持多種網(wǎng)絡(luò)描述格式,也可以用以Tab制表符分隔的文本文檔或Microsoft Excel文件作為輸入,或者利用Cytoscape軟件本身的編輯器模塊直接構(gòu)建網(wǎng)絡(luò),操作方式便捷。
功能介紹:
1、支持多種分析方式,可以選擇分析網(wǎng)絡(luò)。
2、支持分析節(jié)點(diǎn)的子集、批次分析、加載網(wǎng)絡(luò)統(tǒng)計(jì)信息
3、繪制參數(shù)、從統(tǒng)計(jì)信息生成樣式
4、使用可擴(kuò)展對(duì)話框界面顯示網(wǎng)絡(luò)統(tǒng)計(jì)信息
5、在節(jié)點(diǎn)表中存儲(chǔ)節(jié)點(diǎn)參數(shù)、在邊緣表中存儲(chǔ)邊緣參數(shù)
6、明亮的顏色映射標(biāo)準(zhǔn) ameters、暗色映射標(biāo)準(zhǔn) ameters、中間顏色映射標(biāo)準(zhǔn) ameters
7、NetworkAnalyzer、Cytoscape 網(wǎng)絡(luò)瀏覽器
8、合并流程、作業(yè)狀態(tài)監(jiān)視器、命令行對(duì)話框、執(zhí)行命令文件
9、選定的節(jié)點(diǎn)、帶有選項(xiàng)的選定節(jié)點(diǎn)、命令行參數(shù)
10、Cytoscape 的快速游覽、創(chuàng)建網(wǎng)絡(luò)、嵌套網(wǎng)絡(luò)
11、支持的網(wǎng)絡(luò)文件格式、節(jié)點(diǎn)和邊列數(shù)據(jù)
12、風(fēng)格、應(yīng)用程序管理器、命令工具、渲染引擎、導(dǎo)出數(shù)據(jù)
13、Cytoscape 和 OpenCL、Cytoscape.js 和Cytoscape 自動(dòng)化